หลังจากภารกิจสุดแสนอันตรายด้วยการหยุดยั้งขีปนาวุธนิวเคลียร์ในดูไบดำเนินไปสำเร็จแล้ว และ อีธาน ฮันต์ สามารถหลุดพ้นจากการถูกกล่าวหาตกเป็นผู้ต้องหาวางระเบิดในรัสเซียจาก ภาคที่ผ่านมาในภาคนี้ หน่วย IMF ถึงการต้องถูกยุบตัวลง พร้อมกับการหายตัวไปของ อีธาน ฮันต์ เพื่อหลบหนีจากการตามล่าจากกองค์กรลับนาม Syndicate ขณะเดียวกันนั้นเอง ฮันต์ ก็ต้องตามสืบหาร่องรอยของผู้ที่ตามล่าที่แม้กระทั่งหน่วยข่าวกรองอย่าง CIA เองก็ยังไม่สามารถที่จะสืบหาข้อมูลได้ จนกระทั่งเขาพบว่า องค์กรชั่วร้ายที่ว่านี้ก็ถูกฝึกมาให้มีฝีมือระดับพระกาญเช่นเดียวกับหน่วย IMF ของพวกเขา เพียงแต่ว่ามีเป้าหมายที่ต่างกันเท่านั้น เพราะเป้าหมายของ Syndicate ก็คือ การทำลาย IMF ให้สิ้นซาก ศัตรูของเหล่าสายลับ IMF ได้ปรากฏตัวขึ้นอย่างเป็นทางการแล้ว ทางเดียวที่ ฮันต์และเพื่อนในทีมจะสามารถเอาชนะได้ คือ การร่วมมือกันและทุ่มสุดชีวิต เพราะนี่อาจเป็นภาระกิจครั้งสุดท้ายในชีวิตของพวกเขาหก่อนทุกอย่างสายเกินไป จนแก้ไขอะไรไม่ได้
